西藏阜康醫院婦產兒童院區2012年10月設立兒科門診，2013年11月設立兒科住院部，現科室共開放床位51張(普兒床位29張，新生兒床位22張)。配有醫護人員43名，其中副主任醫師1名，主治醫師4人，執業醫師5人， 護理人員32人。開設了兒科專家門診、兒科普通門診、普兒病房、新生兒監護病房，主要負責0～14歲兒童內、外科疾病的就醫診治工作。
科室配心電監護儀25臺、有創呼吸機1臺、無創呼吸機4臺、輸液泵29臺、注射泵22臺、 嬰兒溫箱22臺、經皮測膽紅素儀2臺、床旁心電圖1臺、血氣分析儀1臺、輻射臺2臺、吸痰器4臺、排痰儀1臺、毛巾消毒烘干機1臺、床單位消毒機1臺。
目前開展兒科疾病項目：
普兒：支氣管肺炎、肺動脈高壓、慢性支氣管炎、鵝口瘡、幼兒急疹，高原肺水腫、重癥肺炎、間質性肺炎、過敏性紫癜、皰疹性咽峽炎，急性扁桃體炎等普通兒童病種。
新生兒：新生兒呼吸窘迫綜合征、急性呼吸窘迫綜合征、胎糞吸入綜合征、新生兒高膽紅素血癥、早產兒、低出生體重兒、膿毒血癥、新生兒缺氧缺血性腦病、新生兒壞死性小腸結腸炎、消化道出血等新生兒病種。
還開展了新技術、新業務：動脈血氣分析、心肺腦復蘇、氣管插管、有創無創輔助呼吸、床旁心電圖、初乳口腔護理、鳥巢式護理、袋鼠式護理等。
2019年07月23日與華西附二院華教授聯合在我科開展了兒童先天性心臟病介入手術，共免費救治了31名西藏本地先心病患兒，獲得圓滿成功。
西藏阜康醫院與復旦大學附屬兒科醫院簽訂了兒科聯盟協議，在醫療服務、科學研究、人才培養和醫學繼續教育和醫院管理等領域開展廣泛的實質性合作，按照“高起點、高標準”的發展理念，加快我院兒科專業建設，不斷提升我區兒童醫療衛生服務水平能力，為西藏兒童的健康事業做出我們應有的貢獻。
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